تتولى وكالة الهيئة للمعالجات التجارية مهام حماية الصناعة المحلية في المملكة من الضرر الناتج عن الواردات المغرقة والمدعومة والوقاية من الضرر الناتج عن الزيادة في الواردات عبر فرض تدابير ضد هذه الواردات، والدفاع عن صادرات المملكة التي تتعرض لإجراءات المعالجات التجارية، وذلك عبر آليات المعالجات التجارية في اتفاقيات منظمة التجارة العالمية وهي اتفاقية مكافحة الإغراق واتفاقية الدعم والتدابير التعويضية واتفاقية الوقاية، كما تتولى تمثيل المملكة بهذا الشأن في منظمة التجارة العالمية واللجنة الدائمة لمكافحة الممارسات الضارة بالتجارة في التجارة الدولية بالأمانة العامة لدول مجلس التعاون لدول الخليج العربية وجامعة الدول العربية وتقدم الهيئة للمصدّرين والمنتجين في المملكة المشورة والمساعدة والبرامج والأدلة التوعوية في تحقيقات وموضوعات المعالجات التجارية.